华大基因校企风采

2025-01-20 13 举报
作者:武汉大学深圳研究院

空间转录组学技术,尤其是华大时空组学技术Stereo-seq的出现,能够准确反映细胞的空间排布和RNA的原位表达,帮助科研人员从时间和空间维度上认知每个基因、每个细胞,有望带来生命科学领域的第三次科技革命,成为重新认知器官结构、生命发育、物种演化和定义疾病的底层工具。


对于时空组学技术生产的原始数据,需结合算法工具进行处理、分析,进而找到在空间分布上具有意义的细胞和基因表达。然而,由于该技术的创新性,现有工具包大多仅侧重于空间原位信号的可视化,而缺乏系统性分析数据的方法。


北京时间11月12日,华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构在国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)发表时空算法工具包最新研究。该国际协作团队借鉴了物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型,开创性开发了三维时空建模工具包Spateo,使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。该工具包的发布标志着时空组学研究迎来革新性突破,可全面支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究,为实现高精度时空生命全景观研究迈出了极为关键的一步。


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